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2020-01-01新演算法Lemon縮短開發藥物時程 457 期

Author 作者編輯部

【本刊訊】近年來全球各地的製藥廠，紛紛使用機器學習等演算法系統作為輔助，協助開發全新藥物。但由於演算法需要進行大量的資料分析，以釐清各種化學藥物對人體的影響，因此仍需耗費許多時間才能製造出新藥。來自美國普渡大學（Purdue University）的研究團隊，近日開發出一款新的機器學習演算法，能在短時間內做大量分析，加快製藥進程。

這套全新的演算法名為「檸檬（Lemon）」，可分析蛋白質資料庫（Protein Data Bank, PDB）中高達14萬筆的蛋白質結構，並快速找出適合製作成藥物的成分。過去傳統的演算法，需耗時至少290分鐘的時間加載並分析PDB的資料，但搭載八核心運算的Lemon系統，不但只需花費不到10分鐘的時間即可完成分析，同時利用C++11設計的系統允許使用者自行編寫各種功能，分析使用上也更為彈性。

現階段Lemon系統已可在網路上取得，提供製藥廠或其他相關研究人員使用，可望讓提升藥廠研發與製作的效率。

新聞來源
Jonathan Fine and Gaurav Chopra, Lemon: a framework for rapidly mining structural information from the Protein Data Bank. Bioinformatics, 2019.

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