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2025-02-25以AI設計蛋白質 破解蛇毒血清製作難題 518 期

Author 作者 編譯|陳亭瑋

在醫療科技的發展歷程中,蛇毒血清的製作仍仰賴動物生產,是一直以來都難以突破的領域。最新發表在《自然》(Nature)期刊的一篇研究顯示,透過人工智慧(artificial intelligence, AI)設計的蛋白質,可以有效阻擋眼鏡蛇(Naja)、蝮蛇(Agkistrodon)等毒蛇的致命毒素,為困擾科學家已久的問題帶來新的解決方案。

這項突破性的研究主要是由華盛頓大學西雅圖分校(University of Washington in Seattle)的計算生物物理學家貝克(David Baker)團隊執行。他們運用名為RFdiffusion的蛋白質設計程式,成功開發出能夠識別並中和蛇毒中關鍵毒素的「微型結合蛋白」(minibinders)。此程式的特殊之處在於它借鑒了DALL-E和Midjourney等AI圖像生成工具的技術,能夠在短時間內設計出與目標蛋白質強力結合的小型蛋白質。

研究團隊成員之一的生物化學家托雷斯(Susana Vázquez Torres)將這項技術應用在眼鏡蛇科的三種毒素,包括眼鏡蛇、曼巴蛇(Dendroaspis)、蝮蛇等致命毒蛇身上。團隊也發現,只需要篩選幾十種蛋白質,就能找到能夠強力附著於蛇毒毒素的微型結合蛋白。

在實驗室培養的細胞中,這些微型結合蛋白展現出優異的毒素中和能力,不僅能夠阻斷作用於肌肉和神經細胞的神經傳遞物質,還能防止組織損傷。更令人振奮的是,當研究人員預先混合這些結合蛋白與蛇毒毒素,並注射至實驗小鼠體內時,即使是濃度達致死劑量的毒素也無法對小鼠造成傷害。甚至在模擬真實蛇咬情況下,實驗動物在注射毒素15分鐘後才施用這些結合蛋白,仍可全數存活。

這項技術相較於傳統的蛇毒血清製作方法有顯著優勢。傳統血清需要從經過蛇毒免疫的馬匹或綿羊血液中提取抗體,不僅在安全性和效果上存在差異,還必須由專業醫護人員在醫療機構內施用,大幅限制了它的實用性。相比之下,AI設計的微型結合蛋白具有極高的穩定性,可能不需要冷藏保存,而且還可以透過工業發酵槽中的細菌大量生產,有望降低生產成本。

不過,研究團隊也指出目前的成果僅針對眼鏡蛇科毒素的部分成分,但蛇毒屬於混合物,因此還需要進行更多深入的研究。舉例來說,一個有效的抗蛇毒血清至少需要能夠阻斷磷脂酶(phospholipases)類的毒素,未來的抗蛇毒血清可能會是一個微型結合蛋白的混合物,它的組成將根據使用地區常見的毒蛇種類而有所調整。

儘管這項技術展現出巨大潛力,但要將它轉化為臨床治療仍面臨挑戰。相較於癌症和自身免疫疾病,蛇咬等熱帶疾病的研究資金相對匱乏。不過,這項研究不僅有望解決這個困擾全球的公共衛生問題,還充分展現AI在蛋白質設計領域的強大能力。

新聞來源
Callaway, E. (2025 January 17). AI-designed proteins tackle century-old problem-making snake antivenoms. Nature.